除了系统认证证书自身带来的企业认同感之外，也对企业的运作发作帮助。ISO9001系统认证主要是对公司的质量产品进行确保，可是进行认证的标的并非是产品，而是公司系统。对公司进行系统认证的开始意图是经过控制系统然后控制产品质量，可是跟着系统认证的开展，越来越多的企业发现，不仅仅是企业产品，系统也对公司进行很有力的保护。
例如经过责任到人，可以及早发现问题，而不是各个部门相继推脱。此外ISO9001系统认证在进行时也能及早发现问题。因此经过ISO9001质量认证保护公司，免收意外发作是十分有价值的，这远远超过认证费用的自身，进行认证寻找专业的认证公司。
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